「劇場版 空の境界 未来福音」の同時上映作品。「空の境界」シリーズの原作者・奈須きのこと武内崇による同人サークル「竹箒」名義で2008年に発表された「空の境界 未来福音」（小説2編・漫画3編）に収録されている、武内崇による漫画「1998年」3編をアニメ化した。

1998年8月，和浅上藤乃的战斗后醒来的那天，黑桐干也在两仪式屋里寄存了一只黑猫。式在和藤乃的战斗中失去了左手，带上义肢的她感觉到了左手腕的疼痛。
1998年10月，礼园女子学园的学生宫月认为自己对好朋友安藤由子的自杀负有不可推卸的责任，宫月对人生感到绝望。这时，和宫月同一个学校的学生浅上藤乃出现了。
1998年12月，除夕，黑桐干也和两仪式久违两年来到神社拜祭，途中，干也提起了以前寄放在式家里的黑猫。